Valdo, un apprendista giovane e ambizioso che lavorava per Francesco Melzi, discepolo di Da Vinci, è estremamente deluso quando l´erudito lo allontana improvvisamente.Tuttavia, poco tempo dopo, riceve una lettera da un misterioso patrono, che gli chiede di individuare uno dei codici mancanti di Leonardo.Valdo si introduce allora nell’ultima residenza del maestro e, all’oscuro dei segreti che sta per svelare e del pericolo che si nasconde nell’oscurità, comincia a compiere la sua missione imbattendosi in numerosi personaggi oscuri e intriganti e risolvendo una serie di enigmi basati sulle invenzioni del grande Leonardo Da Vinci.