Sulla rivista @Gamer i programmatori di Bioware hanno annunciato che Mass Effect 3 avrà un livello di difficoltà superiore ai prequel. Per far capire meglio ciò che intendono gli sviluppatori hanno paragonato il livello di difficoltà Normale di Mass Effect 3 a quello Veterano dei primi due episodi. Per aiutare i giocatori sarà possibile riprendere salvataggi precedenti per aumentare il livello del personaggio e prepararsi meglio alle fasi in cui si resterà bloccati, mentre la modalità co-operativa sarà indispensabile se si desidera visionare il finale migliore che propone il gioco.