Il gioco avrà, secondo Konami, una trama completamente originale, che seguirà gli eventi del nuovo personaggio, Murphy Pendleton, un detenuto bloccato nella cittadina di Silent Hill: quest’ultimo inizierà la sua storia in un bosco vicino la periferia della città, dopo essere sopravvissuto ad un’incidente mentre veniva trasportato in autobus in un altro carcere.
