In seguito alle informazioni riportate dalla rivista Game Informer, relative ad un RPG ispirato a James Bond in sviluppo presso Obsidian, il team ha ufficialmente confermato Alpha Protocol, per PlayStation 3 ed Xbox 360.

Il titolo è ambientato nell'epoca attuale, durante la quale i giocatori impersoneranno Michael Thorton, un agente espulso dal proprio governo, ma in possesso di informazioni che potrebbero evitare una imminente catastrofe internazionale. Sega, che produrrà il titolo, ed Obsidian, hanno inoltre rivelato che il protagonista evolverà con il progredire della storia, in base alle decisioni dei giocatori.

Alpha Protocol è approssimativamente previsto per il 2009.